吉原遊廓（新吉原）は、1958年（昭和33年）までおよそ300年間、幕府や日本政府が公認した遊廓街でした。その間、浅草の風俗と文化の源泉となっていました。
湿地帯だったこの地の一部を、遊廓造成の際に池として残し、その畔に弁天祠を祀り吉原弁財天を祀りました。遊廓の総鎮守として吉原の人たちや客に崇敬されてきました。「浅草名所七福神」の弁財天としても親しまれ、芸道富有、子孫繁栄として祀られています。
吉原神社は、吉原遊廓にあった5つの神社が1872年（明治5年）に合祀されて命名されたものです。その後、1935年（昭和10年）に弁財天も合祀され、現在に至っています。